يعتمد تشخيص المايستوما على الأعراض السريرية وتحديد الكائنات المسببة، والتي يمكن اكتشافها من خلال الفحص المباشر للحبيبات التي تُفرزها الجيوب. يمكن الحصول على العينات عن طريق الشفط بالإبرة الدقيقة (FNA) أو الخزعة الجراحية. على الرغم من أن مجهر الحبيبات مفيد في الكشف عن الكائنات المسببة، إلا أنه من المهم تحديدها بشكل أعمق من خلال تزريع العينة، ولكن حتى في هذه الحالة قد يحدث خطأ في التصنيف. يُعدّ التشخيص عن طريق تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) الطريقة الأكثر موثوقية، ولكنه مرتفع التكلفة ويفتقر إلى تقنيات موحدة. لا يوجد اختبار تشخيصي سريع في نقطة الرعاية يمكن استخدامه ميدانيًا. يمكن استخدام تقنيات التصوير، بما في ذلك الأشعة السينية والموجات فوق الصوتية والرنين المغناطيسي والتصوير المقطعي المحوسب، لتقييم مدى انتشار الآفات وتخطيط العلاج السريري.
